ユニポスWEBサイトでご紹介しておりました、分子モデリングとデータ解析機能を備えた計算化学ツール Molecular Modeling Pro Plus は、販売終了いたしました。
Molecular Modeling Pro Plusは、分子モデリング機能、データベース機能、データ解析機能を有する、計算化学のためのソフトウェアです。
美しいグラフィックスによる3D分子モデルの描画と分子構造の最適化、分子と特性のデータベース作成や編集、 QSAR置換基データベースの自動作成や編集のほか、分子軌道法計算プログラム(MOPAC、CNDO)のパブリックドメインをサポートしており量子力学計算も可能です。
またデータ解析では、モデルを自動生成するために QSAR / QSPRモデルの2つの方法があり、迅速な統計に役立ちます。 解析には総当たりおよびステップワイズ法、予測二乗和(PRESS)統計分析、残差プロットなどを含む重回帰分析、PLS、主成分、2Dおよび3Dチャートなど便利なツールが含まれます。
※代替品をお探しの場合は、お気軽にお問い合わせください
例）イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校が開発・配布しているオープンソースの分子動力学シミュレーションプログラムNAMD(Nanoscale Molecular Dynamics)も、類似製品です。詳細は、こちらをご参照ください。
主な機能
分子モデリング
- Draw in 3-D structures
- Optimize structures with MM2, MOLY, or MOPAC
- Find global minima with Conformational analysis or Quick MM2
- Display as wire frame, ball and stick, dot surface or shaded spheres or a combination of wireframe and spheres
- Rotate in real time
- Calculate over 200 chemical properties from structures
- Semi-empirical quantum chemistry with MOPAC (v. 6) or CNDO
- Create chemical databases with structures and calculated properties
- Create QSAR databases automatically by adding substituents to substructures with substituent values from the literature.
- Create databases automatically from subdirectories of molfiles. Minimize whole subdirectories of molfiles automatically.
- Create web pages automatically including rotating molecules.
- Substructure searching of directories of molecules.
- Reaction editor
データベース
- Database viewing with editing capability. Add new records and fields. Add and edit values as in a spreadsheet.
- Substructure, value and text searching of molecules in the database.
- Spreadsheet or single molecule views. Similarity searching using substructure keys, molecular properties, or 3-D volume and charge distributions.
- Connection to ChemSite allows viewing of molecules in MMP+ databases in ChemSite on the fly.
- Some reaction database capability.
- Reads Microsoft ACCESS, Molecular Analysis Pro csv, tab-delimited text, comma delimted text, MDL SD File, and XML formats.
- Writes to Microsoft ACCESS, MAP csv, tab-delimited text, MDL SD File, XML, html web page, and Microsoft Excel formats.
- Database size limited by available memory (256 field limitation.)
- Sort and subset by value.
データ解析
- 総当たりおよびステップワイズ法、予測二乗和(PRESS)統計分析、残差プロットなどを含む重回帰分析
– Automated substructure fragment model generation.
– Partial least squares regression (PLS) with cross-validation.
– Principle Components Analysis
– 2-D x-y plots with many options
– 3-D plots, contour plots, 4-D rotating graphs
– Includes extensive tutorial on use of the program for data analysis in the on-line Help
その他
・Molecular Modeling Pro Plus は 年間ライセンスです
・アカデミックユーザー向けには、1年間 1クラス(1教室)でMolecular Modeling Pro Plusをご利用いただけるサイトライセンスが提供されます
(ライセンス期間中、該当のクラスに在籍する生徒がコンピュータにプログラムをダウンロード可能です。ただし購入から1年後、これらのライセンスは失効します)。
・ChemicaElectrica Gatewayプログラムと、10,700を超える分子・100 MB を超えるデータのChemicElectricaデータベースが含まれています
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■本製品は終息いたしました |